Kovalevskaya Sofia Vasilievna syntyi 3. tammikuuta 1850 Moskovassa. Hänen äitinsä oli Elisabeth Schubert. Isä, tykistön kenraali Korvin-Krukovsky toimi tyttärensä syntymän aikaan arsenaalin päällikkönä. Kun tyttö oli kuusi, hän jäi eläkkeelle ja asettui perhetilalle